集装箱理箱是指集装箱装卸船时进行清点箱数、核对箱号和铅封号、检查集装箱外表状态和铅封完好情况、编制有关单证等业务内容。集装箱卸船理箱时，理货组长登轮后先向船方了解集装箱积载情况，商定残损箱验残方法，征求对理箱的要求，并把以上事项记录在交接簿上。对近洋航线的船舶，要向船方索取舱单、装箱单、积载图等资料。卸船时按集装箱卸船程序表和积载图，认真核对箱号和铅封号，对已卸船的集装箱进行圈销。在卸船过程中如发现箱体损伤，应及时会同船方验看，同时把残损情况填入设备交接单，由船方签认。如发现集装箱铅封断失，应重新施封，并将铅封号填入理箱单内，并编制施封/验封记录。装船理箱时，理货组长也应先向船方核对集装箱装载位置，征求对理箱要求，并记录在交接簿上，其他作业与卸船时相同。装船结束，理货组长根据理箱单、设备交接单和载货清单(卸船时为舱单)，汇总编制集装箱溢短/残损单、理货证明书等理货单证，并绘制积载图或修正配载图。集装箱船的装卸速度很快，为节省制单时间，应尽量提前把单证制好，以便理货员在装卸船时能集中精力理箱，核对预先制好的单证。