南疆铁路东起兰新铁路的吐鲁番站，西至南疆重镇喀什市。全长1470.4千米。南疆铁路第一期工程由吐鲁番至库尔勒段，长495.4千米。该段从1971年7月1日动工，至1979年8月9日建成，共完成路基土石方3477万立方米，架设桥梁462座，修建隧道30座(其中1000米以上隧道11座，奎先隧道长达6152米)，总投资11.25亿元。库尔勒西至喀什段，是南疆铁路建设的第二期工程，1996年9月6日开工。该段沿天山南麓、塔里木盆地北缘西行，经轮台、库车、新和、阿克苏、巴楚、阿图什至喀什，长975千米。该段线路为国家Ⅱ级单线铁路，设计总概算58.8亿元，全线内燃机车牵引。规划运输能力：库尔勒至阿克苏段，客车4对，货运每年1200万吨;阿克苏至喀什段，客车3对，货运每年1000万吨。1999年5月6日铺轨到终点喀什，12月6日正式开通运营。